Beruang, hamster, humanoid. Hamster atau beruang adalah saudara bagi seseorang dari sudut pandang bioinformatika?

Untuk menjawab pertanyaan tersebut maka dalam penelitian ilmiah perlu ditentukan maksud, tujuan dan metode, serta materi yang diteliti. Untuk melakukan ini, Anda perlu mencoba mengajukan hipotesis yang akan memudahkan kita memahami apa yang kita inginkan, dan oleh karena itu, memungkinkan kita untuk memilih bahan penelitian. Sebagai hipotesis, Anda dapat mengandalkan pengetahuan Anda tentang klasifikasi kelompok hewan. Namun, jika Anda tidak memiliki pengetahuan tersebut dan Anda tidak ingin menderita mencari pengetahuan ini di ladang, hutan dan laboratorium, maka Anda dapat menjadi pengguna Internet tingkat lanjut dan menggunakan peta kehidupan situs yang nyaman [1], yang menampilkan filogenetik pohon dari semua binatang. Jika Anda bukan pengguna mahir, maka Anda dapat menggunakan Wikipedia. Perlu dicatat bahwa bagi seorang ilmuwan, situs Lifemap sama primitifnya dengan Wikipedia,Tapi jangan takut untuk memulai dari yang kecil, karena wikipedia dapat berfungsi sebagai pendorong evolusi dari yang sederhana ke yang kompleks. Jadi mari kita berevolusi di wiki bersama-sama. Untuk melakukan ini, kami akan membuka mesin pencari dan melihat informasi tentang grup yang kami butuhkan, yang akan kami kerjakan di masa mendatang, di situs ini. Yang pertama dalam daftar adalah bearish. Di halaman situs, kita tidak perlu mempelajari struktur, reproduksi, dan gaya hidup beruang secara menyeluruh. Kami membutuhkan tiga hal:Kami membutuhkan tiga hal:Kami membutuhkan tiga hal:





  1. Bagian klasifikasi ilmiah.





  2. Bagian dari filogenetik.





  3. Ringkasan klasifikasi yang ditampilkan di pojok kanan atas di bawah gambar klasifikasi ilmiah.





Masuk ke bagian klasifikasi ilmiah dan lihat daftar marga di keluarga beruang, setelah sebelumnya menuliskan nama keluarga ini dalam bahasa Latin (Ursidae). Kami membutuhkan nama dari semua genera dalam bahasa Latin yang ada di dalam famili. Juga lebih baik untuk menuliskannya (Gbr. 1).





(gbr. 1)





Setelah pekerjaan selesai, kita pergi ke bagian filogenetik dan memilih harta karun dengan kerabat terdekat yang masih hidup sebagai cadangan.





Ini harus dilakukan jika kita tidak dapat menemukan urutan genetik beruang yang dibutuhkan dari genera berbeda di bank gen (Gbr. 2).





, — . , .





(.3). « » .





(.3)





4.1. « ». , (.4). , .





(.4)





. «» (.5) , . , ?





(.5)





. (.6).





(.6)





! Euarchontoglires ! . , . , , . :





  1. NCBI [2].





  2. , .





  3. , , NCBI.





  4. .





  5. .





, . , , . , ( ) . , [4]. . . , .





. 18S . 18S 70- . , 18S , ; , . 18S , , . – -, – . [3].





- , . , . , , — , — . , . «Sequence length» (1600-2500) «Search» (.7).





, , (. 8). , , .





(. 8).





"fasta". C ( , ) MEGA 10 «fasta» (.9)





(.9)





, 8 . , - «». — . — , — . — . MEGA 10





. . , . , [5]. MEGA 10, [6]. «fasta» (.10).





(.10)





(. 11) , , 12. «Submit» , fasta, 13.





(.11)





(.12)





(.13)





. ! (.14)





(.14)





. . , , . , . , (.15.)





(.15)





, . , , . , , Hasegawa, Kishino Yano 1985 .





, [7]. , 1000 ( ). , , . 70% , (.16). 70% , , , 70% .





(.16)





, , (.17).





(17).





, .





, , . , (.. ), , . , 1/6. , , , . , , , , [4]. .





, , . , IT [5]. , , , , . ( 18). , .





(.18)





, , . ! (.19) ;(.20)





(.19)





(.20)





— , !





, , !





, , , 70%, , 70%. , , . «» , , ! !





:

26.01.2021 27.01.2021 - (https://vk.com/phanerozoi).





:
  1. http://lifemap.univ-lyon1.fr





  2. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/?term=Phocidae+18S+ribosomal+gene





  3. .. - 18S : / .., .., .., ..- : -, 2011 – 52 .





  4. / .. —.. , 2009. — .256. .92-123.





  5. Mount DM. Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis. — 2nd. — Cold Spring Harbor Laboratory Press: Cold Spring Harbor, NY., 2004.





  6. https://mafft.cbrc.jp/alignment/server/





  7. Hasegawa M., Kishino H., dan Yano T. ( 1985 ). Penanggalan manusia-kera yang dipisahkan oleh jam molekuler DNA mitokondria. Jurnal Evolusi Molekuler  22 : 160-174.





  8. https://habr.com/ru/company/mailru/blog/217839/
















All Articles